7月3日,传感器技术领域国际权威期刊Sensors and Actuators B: Chemical(中科院一区,影响因子8.0)在线发表了我院教师王佩博士的研究论文“A highly sensitive on-site duplex genotyping method dRPG for simultaneous detection of SARS-CoV‑2 key mutations with single nucleotide resolution”。
基因分型是确定可能导致生物表型重大变化的基因差异的技术,已成为核酸检测的重要组成部分。目前已有的基因分型检测方法包括DNA测序、质谱、分子信标、微阵列和基于PCR的方法等,这些方法精确、灵敏且特异,但依赖于实验室设备和专业人员,限制了基因分型技术在现场检测中的广泛应用。另一方面,多重检测能力是对基因分型检测技术的一个关键要求,这是由于在大多数情况下,通过一系列基因位点的变异分析才能确定一个有意义的基因分型结果。在本研究中,我院教师王佩博士利用来源于激烈火球菌的Argonaute蛋白(PfAgo)的高度特异性识别能力和多靶标区分能力,与核酸等温扩增技术重组聚合酶扩增(RPA)相结合,建立了一种新型双重基因分型方法,称为双重RPA-PfAgo基因分型法(dRPG)。该方法实现了对新冠病毒两个关键突变位点L452R和E484Q的同时检测,且达到了单核苷酸差异的分辨率。该研究首次将PfAgo与RPA结合应用于新冠病毒的多突变位点检测,能满足现场检测中对准确性、灵敏度和简易性要求,可有效应用于对新冠病毒突变的长期追踪,且为精准医学、分子育种、病原检测和食品安全领域中重要核酸靶标的现场多重基因分型检测提供了新的技术路径。
该论文的第一完成单位是盐城师范学院海洋与生物工程学院,我院教师王佩博士为该论文的通讯作者。论文的合作单位还包括江苏海洋大学和南京师范大学。该论文的研究得到了国家自然科学基金和中国博士后科学基金等项目的支持。
原文链接:
Chenjie Zhao, Yixin Tang, Miao Xu, Yue Wang, Bo Luo, Pei Wang, Song Gao. A highly sensitive on-site duplex genotyping method dRPG for simultaneous detection of SARS-CoV‑2 key mutations with single nucleotide resolution. Sensors and Actuators B: Chemical, 2024, 418, 136238. https://doi.org/10.1016/j.snb.2024.136238.